Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms