Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn6Q9Z262 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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