Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms