Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmg20bQ9Z104 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hmg20bQ9Z104 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hmg20bQ9Z104 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hmg20bQ9Z104 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmg20bQ9Z104 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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