Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms