Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms