Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx9Q9WUH2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms