Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms