Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms