Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nphp1Q9QY53 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nphp1Q9QY53 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms