Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms