Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms