Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms