Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad1Q9QWZ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad1Q9QWZ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms