Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Homer2Q9QWW1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms