Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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