Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace2Q9JL18 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms