Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AatfQ9JKX4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AatfQ9JKX4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms