Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms