Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms