Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Tmod2Q9JKK7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod2Q9JKK7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms