Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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