Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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