Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms