Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf8Q9EQH4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms