Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3bpQ9EQG9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms