Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tlr1Q9EPQ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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