Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf580Q9DB38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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