Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfn3Q9DAD6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfn3Q9DAD6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfn3Q9DAD6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfn3Q9DAD6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfn3Q9DAD6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms