Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph3bQ9DA80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms