Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms