Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph9Q9D9V4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms