Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms