Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms