Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc52a2Q9D8F3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a2Q9D8F3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms