Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms