Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms