Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms