Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms