Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm3404Q9D506 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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