Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms