Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms