Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Sgms2Q9D4B1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Sgms2Q9D4B1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms