Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms