Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms