Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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