Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms