Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms