Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms