Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms